Temporal transcriptional profiling of host cells infected by a veterinary alphaherpesvirus using nanopore sequencing

QR kód

Temporal transcriptional profiling of host cells infected by a veterinary alphaherpesvirus using nanopore sequencing

In our research, we performed temporal transcriptomic profiling of host cells infected with Equid alphaherpesvirus 1 (EHV-1) by utilizing direct cDNA sequencing based on nanopore MinION technology. The sequencing reads were harnessed for transcript quantification at various time points. Viral infect...

Teljes leírás

Elmentve itt :

Bibliográfiai részletek
Szerzők:	Tombácz Dóra Maróti Zoltán Oláh Péter Dörmő Ákos Gulyás Gábor Kalmár Tibor Csabai Zsolt Boldogkői Zsolt
Dokumentumtípus:	Cikk
Megjelent:	2025
Sorozat:	SCIENTIFIC REPORTS 15 No. 1
Tárgyszavak:	Biológiai tudományok Általános orvostudomány
doi:	10.1038/s41598-025-87536-0
mtmt:	35730680
Online Access:	http://publicatio.bibl.u-szeged.hu/36113

Hasonló tételek

In-depth Temporal Transcriptome Profiling of Monkeypox and Host Cells using Nanopore Sequencing
Szerző: Kakuk Balázs, et al.
Megjelent: (2023)

Time course profiling of host cell response to herpesvirus infection using nanopore and synthetic long-read transcriptome sequencing
Szerző: Maróti Zoltán, et al.
Megjelent: (2021)

High temporal resolution Nanopore sequencing dataset of SARS-CoV-2 and host cell RNAs
Szerző: Tombácz Dóra, et al.
Megjelent: (2022)

Mapping the temporal transcriptomic signature of a viral pathogen through CAGE and nanopore sequencing
Szerző: Tombácz Dóra, et al.
Megjelent: (2025)

Time-course profiling of bovine alphaherpesvirus 1.1 transcriptome using multiplatform sequencing
Szerző: Moldován Norbert, et al.
Megjelent: (2020)

Dynamic Transcriptome Sequencing of Bovine Alphaherpesvirus Type 1 and Host Cells Carried Out by a Multi-Technique Approach
Szerző: Tombácz Dóra, et al.
Megjelent: (2021)

Hybrid sequencing discloses unique aspects of the transcriptomic architecture in equid alphaherpesvirus 1
Szerző: Tombácz Dóra, et al.
Megjelent: (2023)

Transcriptome-wide analysis of a baculovirus using nanopore sequencing
Szerző: Boldogkői Zsolt, et al.
Megjelent: (2018)

Long-read sequencing revealed an extensive transcript complexity in herpesviruses
Szerző: Tombácz Dóra, et al.
Megjelent: (2018)

Time-course transcriptome analysis of host cell response to poxvirus infection using a dual long-read sequencing approach
Szerző: Maróti Zoltán, et al.
Megjelent: (2021)

Full-Length Isoform Sequencing Reveals Novel Transcripts and Substantial Transcriptional Overlaps in a Herpesvirus
Szerző: Tombácz Dóra, et al.
Megjelent: (2016)

Combined nanopore and single-molecule real-time sequencing survey of human betaherpesvirus 5 transcriptome
Szerző: Kakuk Balázs, et al.
Megjelent: (2021)

Transcriptome dataset of six human pathogen RNA viruses generated by nanopore sequencing
Szerző: Prazsák István, et al.
Megjelent: (2022)

Nanopore Assay Reveals Cell-Type-Dependent Gene Expression of Vesicular Stomatitis Indiana Virus and Differential Host Cell Response
Szerző: Kakuk Balázs, et al.
Megjelent: (2021)

Third-generation sequencing reveals extensive polycistronism and transcriptional overlapping in a baculovirus
Szerző: Moldován Norbert, et al.
Megjelent: (2018)

Multi-platform sequencing approach reveals a novel transcriptome profile in pseudorabies virus
Szerző: Moldován Norbert, et al.
Megjelent: (2018)

Short and Long-Read Sequencing Survey of the Dynamic Transcriptomes of African Swine Fever Virus and the Host Cells
Szerző: Olasz Ferenc, et al.
Megjelent: (2020)

Comparative evaluation of veterinary active ingredients and formulations
Szerző: Klátyik Szandra, et al.
Megjelent: (2017)

Characterisation of host-pathogen interaction during Candida infections
Szerző: Németh Tibor Mihály
Megjelent: (2012)

Exploring the transcriptomic profile of human monkeypox virus via CAGE and native RNA sequencing approaches
Szerző: Nagy Gergely Ármin, et al.
Megjelent: (2024)

Multi-platform next-generation sequencing identifies novel RNA molecules and transcript isoforms of the endogenous retrovirus isolated from cultured cells
Szerző: Moldován Norbert, et al.
Megjelent: (2018)

Characterization of novel transcripts in pseudorabies virus
Szerző: Tombácz Dóra, et al.
Megjelent: (2015)

Dynamic Transcriptome Profiling Dataset of Vaccinia Virus Obtained from Long-read Sequencing Techniques
Szerző: Tombácz Dóra, et al.
Megjelent: (2018)

Injuries caused by bites by dogs and cats from the aspect of the veterinary
Szerző: Kereszty Gábor
Megjelent: (2016)

Evaluation of whole exome sequencing as an alternative to BeadChip and whole genome sequencing in human population genetic analysis
Szerző: Maróti Zoltán, et al.
Megjelent: (2018)

Interactions between the transcription and replication machineries regulate the RNA and DNA synthesis in the herpesviruses
Szerző: Boldogkői Zsolt, et al.
Megjelent: (2019)

Novel Classes of Replication-associated Transcripts Discovered in Viruses
Szerző: Boldogkői Zsolt, et al.
Megjelent: (2019)

Cross-comparison of gut metagenomic profiling strategies
Szerző: Gulyás Gábor, et al.
Megjelent: (2024)

Evaluation of the impact of ul54 gene-deletion on the global transcription and DNA replication of pseudorabies virus
Szerző: Csabai Zsolt, et al.
Megjelent: (2017)

Understanding p300-transcription factor interactions using sequence variation and hybridization
Szerző: Hobor Fruzsina, et al.
Megjelent: (2022)

Strain Kaplan of Pseudorabies Virus Genome Sequenced by PacBio Single-Molecule Real-Time Sequencing Technology
Szerző: Tombácz Dóra, et al.
Megjelent: (2014)

Characterization of pseudorabies virus transcriptome by Illumina sequencing
Szerző: Oláh Péter, et al.
Megjelent: (2015)

Transcriptional profiling of ion channel genes in Brugada syndrome and other right ventricular arrhythmogenic diseases
Szerző: Gaborit Nathalie, et al.
Megjelent: (2009)

Correlations of the quality of the pollen grains with the temporal sequence of pollen dispersion in the different parts of the inflorescences
Szerző: Pálfi Gábor, et al.
Megjelent: (1988)

The changing of the host translation and linguistic history /
Szerző: Prickett Stephen
Megjelent: (1992)

The changing of the host translation and linguistic history /
Szerző: Prickett Stephen
Megjelent: (1992)

An Integrated Sequencing Approach for Updating the Pseudorabies Virus Transcriptome
Szerző: Torma Gábor, et al.
Megjelent: (2021)

The Effect of Trap States on the Optoelectronic Properties of Nanoporous Nickel Oxide
Szerző: Balog Ádám, et al.
Megjelent: (2019)

Molecular and Electrophysiological Characterization of GABAergic Interneurons Expressing the Transcription Factor COUP-TFII in the Adult Human Temporal Cortex.
Szerző: Varga Csaba, et al.
Megjelent: (2015)

Multiple Long-read Sequencing Survey of Herpes Simplex Virus Dynamic Transcriptome
Szerző: Tombácz Dóra, et al.
Megjelent: (2019)